L'arbre peut être peu façonné (grumes, billes, billons, rondins, etc.) ou plus façonné juste après la coupe ou en parc à bois (quartiers, plaquettes, etc.).
L'immunoprécipitation proprement dite est alors terminée : les protéines que l'on cherchait à isoler sont collées aux anticorps qui sont eux–mêmes collés aux billes.