Einer der Kritikpunkte ist dabei, dass die Kategorien sich teilweise auf Anschauungen (Einzelheit, Realität, Dasein), teilweise auf Abstraktionen wie Zusammenfassen, Begrenzen oder Begründen (Vielheit, Allheit, Negation, Limitation, Möglichkeit, Notwendigkeit) beziehen.
Nachteilig wirkt sich dagegen die Limitation der Gaszugabe in die Fermentationsbrühe, die niedrige volumetrische Produktivität sowie die Inhibierung der Organismen durch höhere Produktkonzentrationen aus.